Misja wystartowała 7 lutego 2001 o godz. 23:13:00 UTC ze stanowiska startowego LC-39A KSC (Launch Complex 39A, Kennedy Space Center) na Florydzie (USA).
Załoga odbyła 3 spacery kosmiczne w celu montażu modułu Destiny
EVA 1 – 7 godzin 34 minuty – 10 lutego 2001 15:50 – 23:24 UTC
EVA 2 – 6 godzin 50 minut – 12 lutego 2001 15:59 – 22:49 UTC
EVA 3 – 5 godzin 25 minut – 14 lutego 2001 14:48 – 20:13 UTC

Załoga STS-98 (z przodu od lewej) Mark L. Polansky – pilot, Kenneth D. Cockrell – dowódca misji, (na środku) Marsha S. Ivins – inżynier lotu i specjalista misji 2, (z tyłu od lewej) Robert L. Curbeam, Jr. – specjalista misji 1, Thomas D. Jones – specjalista misji 3.
26698 – NSSDCA/COSPAR ID: 2001-006A – STS 98
26700 – NSSDCA/COSPAR ID: 2001-006B – Destiny